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Conformational analysis by NMR and molecular modelling of the 41–62 hydrophilic region of HIV-1 encoded virus protein U (Vpu). Effect of the phosphorylation on sites 52 and 56

✍ Scribed by Gaël Coadou; Nathalie Évrard-Todeschi; Josyane Gharbi-Benarous; Richard Benarous; Jean-Pierre Girault


Book ID
104429989
Publisher
Elsevier Science
Year
2001
Tongue
English
Weight
299 KB
Volume
4
Category
Article
ISSN
1387-1609

No coin nor oath required. For personal study only.

✦ Synopsis


The peptide of 22 amino acid residues, Vpu_P 41-62 , phosphorylated at the two sites Ser 52 and Ser 56 has been implicated in the degradation of CD4 receptor molecules, an important stage of the pathways to human immunodeficiency virus type 1 pathology (HIV-1). In order to assess the structural influence of phosphorylation, a conformational analysis by NMR and molecular simulation have been carried out for the phosphorylated Vpu_P 41-62 , and non-phosphorylated Vpu 41-62 in both H 2 O (at pH 3.5 and 7.2) and a 1:1 mixture of H 2 O and trifluoroethanol. Analysis of the short-, medium-range NOE connectivities and of the secondary chemical shifts indicated that the peptide segment (42-49) shows a less well-defined helix propensity. The 50-62 segment forms a loop with the phosphate group pointing away, a short β-strand and a flexible extended 'tail' of residues 60-62. Differences in this molecular region 50-62 suggest that conformational changes of Vpu_P, play a potential role in Vpu_P-induced degradation of CD4 molecules. © 2001 Académie des sciences / Éditions scientifiques et médicales Elsevier SAS Vpu / HIV-1 / CD4 / NMR Résumé -Vpu_P 41-62 , peptide de 22 acides aminés, phosphorylé sur les sérines Ser 52 et Ser 56 , est impliqué dans la dégradation du récepteur CD4, étape importante pour la production optimale de particules virales infectieuses VIH-1. Afin de mieux comprendre l'influence de la phosphorylation sur la structure, une étude conformationnelle par RMN et modélisation moléculaire a été effectuée sur les peptides Vpu_P 41-62 , phosphorylé, et Vpu 41-62 , non phosphorylé dans H 2 O et dans un mélange H 2 O/trifluoroethanol 1:1. L'analyse des NOEs et des indices de déplacement chimique confirment la tendance du segment 42-49 à former une hélice. En revanche, les deux sérines phosphorylées tendent à induire, pour le fragment 50-62, une structuration nouvelle, de type β. Les différences observées pour cette région 50-62 suggèrent que ces changements conformationnels jouent un rôle important dans la dégradation des molécules CD4 induite par Vpu_P.


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