Nucleoside und Nucleotide. Teil 20. Synthese von Desoxyribooligonucleotiden nach der Diester- und Triestermethode mit 2(1H)-Pyrimidinon als Base

✍ Scribed by Hans-Dieter Schneider; Christoph Tamm

• Publisher: John Wiley and Sons
• Year: 1983
• Tongue: German
• Weight: 820 KB
• Volume: 66
• Category: Article
• ISSN: 0018-019X
• DOI: 10.1002/hlca.19830660131

✦ Synopsis

The syntheses of the dinucleosidemonophosphate 1-(2'-deoxy-P-~-ribofuranosyl)-2 (1 H)-pyrimidinon-(3'-5')-2'-deoxycytidine (M&Cd; 4) and the trinucleosidediphosphate thymidyl-(3'-5')-thymidylyl-(3'-5')-l-(2'-deoxy-~-~-ribofuranosyl)-2 (1 H)-pyrimidinon (TdpTdpMd; 1) are described. Compound 1 was synthesized by different variants of the triester method, and 4 by the diester method as well as the triester method. 1. Einleitung. -Fur die Aufklarung der Spezifitat der DNA-Polymerase eignen sich besonders gut unnaturliche Nucleotide, deren Basen nur noch beschrankt zur Ausbildung von Wasserstoffbrucken nach dem Prinzip von Watson & Crick [3] zu den naturlichen Nucleotiden fahig sind. Im Rahmen des Konzeptes [4] zur Untersuchung der DNA-Polymerase-Spezifitat anhand einer DNA-Matrize, die ein unnaturliches Nucleotid enthalt, benotigten wir das Trinucleosiddiphosphat 5'-0-Monomethoxytritylthymidyl-(3'-5')-thymidylyl-(3 '-5')-1 -(2'-desoxy-/?-~-ribo-furanosy1)-2 ( 1 H)-pyrimidinon ((MeOTr)T&TdpMd; Ferner war das Reaktionsverhalten von Md4) hinsichtlich der Synthese von MdPCd (4) abzuklaren. Da durch die Synthesen von MdpTd und MdpGd [6] und weitere Synthesen von Dimeren und Trimeren mit den unnatiirlichen Nucleosiden T C ~) [7-91 und zd4) [ 101 eine betrachtliche Erfahrung im Umgang mit der Diestermethode [ 1 11 gewonnen worden war, wurden die Synthesen von (Me0Tr)TdpTdpMd (1) und von MdPCd (4) ebenfalls nach diesem Syntheseprinzip vorgenommen. I) Teil 19: [l]. *) Fur Einzelheiten vgl. [2]. 3, Korrespondenzautor. 4, Zu den Abkiirzungen vgl. [5]. Thymidyl= Thymidin-3'-0-y1, Thymidylyl= Thymidin-3',5'-di-O-y1, Md= 1-(2'-Desoxy-~-~-ribofuranosyl)-2( 1H)-Pyrimidinon, R d = 1-(2'-Desoxy-P-~-ribofuranosyl)-2( 1H)-pyridinon und z d = 4-Amino-l-(2'-desoxy-~-~-ribofuranosyl-2( 1H)-pyridinon, p = 4-Chlorphenylphosphat.